از آنجا که شهر آمل از پیشینه ای تابناک در دانش و فرهنگ برخوردار بوده و شهر عارفان، فیلسوفان و فرهیختگان به شمار می آید و از این حیث به حق  بر تارک تاریخ می درخشد؛ لذا دانشکده علوم قرآنی آمل در سال تحصیلی 74-1373 تأسیس و با انتقال 24 دانشجو از دانشکده علوم قرآنی تهران شروع به کار نمود، و در سال تحصیلی 75-74 به همراه سایر دانشگاه ها و مؤسسات آموزش عالی ازطریق آزمون سراسری پذیرای 80 دانشجوی علاقه مند به این رشته گردید

در سال 1374 قطعه زمینی به مساحت 7000 مترمربع که بخش قابل توجهی از آن توسط دو تن از خیرین و مابقی ازطرف شهرداری اهدا شد، جهت بنای ساختمان در نظر گرفته شد. بدین ترتیب ساخت محل جدید دانشکده از سال 1374 آغاز و در سال 1380 با پایمردی و همت مسئولین و خیرین پایان پذیرفت. ساختمان دانشکده در چهارطبقه و با زیربنای6500 مترمربع بنا گردید که به دو بخش اداری و آموزشی تقسیم می شود.  دانشکده دارای 15 کلاس بوده که گنجایش 750 دانشجو را در یک نوبت دارا می باشد. بخشهای دیگر دانشکده عبارتند از: کتابخانه ای به وسعت حدود 500 مترمربع، دارای دو سالن مطالعه برادران و خواهران به ظرفیت 300 نفر، سالن اجتماعات با ظرفیت 240 نفر، سالن کنفرانس ، نمازخانه و سالن غذاخوری و سالن ورزشی.